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細(xì)胞分裂周期蛋白6拷貝數(shù)變異與肺腺癌患者預(yù)后關(guān)系的研究

作者:寇瑞環(huán); 謝俞寧; 李佳瑩; 金葉; 張志; 張雪梅 華北理工大學(xué)附屬唐山市工人醫(yī)院腫瘤科; 河北唐山063210; 華北理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 河北唐山063210

摘要:目的探討細(xì)胞分裂周期蛋白6(CDC6)基因在肺腺癌組織中的拷貝數(shù)變異(CNV)對肺腺癌預(yù)后的影響。方法從癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中獲取肺腺癌患者的轉(zhuǎn)錄譜(mRNA)數(shù)據(jù)、CNV數(shù)據(jù)及臨床資料,使用基因表達(dá)譜動態(tài)分析(GEPIA)數(shù)據(jù)庫對CDC6基因在肺腺癌組織中的表達(dá)情況,及其與CDC6基因CNV和肺腺癌患者預(yù)后的關(guān)系進(jìn)行分析。篩選CDC6基因的共表達(dá)基因,并進(jìn)行基因組百科全書(KEGG)通路分析及基因本體(GO)功能富集分析。結(jié)果肺腺癌患者腫瘤組織中CDC6基因CNV與CDC6mRNA的表達(dá)量呈正相關(guān)(P﹤0.01)。CDC6低表達(dá)組肺腺癌患者的生存結(jié)局明顯優(yōu)于CDC6高表達(dá)組患者(P﹤0.01)。KEGG通路分析結(jié)果顯示:CDC6基因的共表達(dá)基因富集在DNA復(fù)制、錯配修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)等修復(fù)相關(guān)通路。GO功能富集分析結(jié)果顯示:在生物學(xué)過程層面,CDC6基因的共表達(dá)基因主要參與了DNA鏈的延伸、核酸切除修復(fù)、蛋白質(zhì)去甲?;?、轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)切除修復(fù)、WNT信號通路、平面細(xì)胞極性通路、核因子-κB誘導(dǎo)激酶(NIK)/核因子-κB(NF-κB)信號通路;在細(xì)胞構(gòu)成層面,CDC6基因的共表達(dá)基因參與了T復(fù)合物、透明帶受體復(fù)合物、驅(qū)動蛋白復(fù)合體、DNA復(fù)制因子C復(fù)合物的形成;在分子功能層面,CDC6基因的共表達(dá)基因參與四鏈體DNA結(jié)合。結(jié)論CDC6基因CNV可以對肺腺癌組織中CDC6基因的表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,CDC6基因及其共表達(dá)基因可對肺腺癌的DNA復(fù)制、修復(fù)過程和腫瘤相關(guān)信號通路進(jìn)行調(diào)控并可能以此為基礎(chǔ)影響肺腺癌的發(fā)展進(jìn)程。CDC6基因高表達(dá)肺腺癌患者的預(yù)后不良,其可能成為預(yù)測肺腺癌臨床預(yù)后的有效生物標(biāo)志物。

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