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刺齒報(bào)春苣苔酮脂酰-輔酶A合成酶基因的鑒定及序列分析

作者:梁燕妮; 覃信梅; 陳超杰 梧州學(xué)院; 廣西梧州543000; 廣西壯族自治區(qū)中國科學(xué)院廣西植物研究所; 廣西桂林541006

摘要:【目的】為進(jìn)一步探討刺齒報(bào)春苣苔酮脂酰-輔酶A合成酶基因的分子結(jié)構(gòu)和功能,并為刺齒報(bào)春苣苔適應(yīng)極端干旱環(huán)境提供分子依據(jù)?!痉椒ā靠俁NA的提取采用改良Trizol法,通過轉(zhuǎn)錄組測序獲得與刺齒報(bào)春苣苔( Primulina spinulosa )抗旱及應(yīng)對生物脅迫反應(yīng)有關(guān)的基因:酮脂酰-輔酶A合成酶基因,并運(yùn)用DNAman、Finder、TMPRED、SWISS-MODEL、NetPhos2.0、SignaIP4.1等軟件對序列的開放閱讀框(ORF)、編碼氨基酸、編碼蛋白質(zhì)等理化特性進(jìn)行分析,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。【結(jié)果】序列分析結(jié)果表明,該基因全長1 935 bp(GenBank登錄號(hào)為MH543314),開放閱讀框(ORF)為1 599 bp,共編碼532個(gè)氨基酸,編碼蛋白質(zhì)的分子量為59.82 kDa,理論等電點(diǎn)(pI)為9.16,為親水性蛋白,含7個(gè)跨膜區(qū),30個(gè)可能的磷酸化位點(diǎn),1個(gè)與查爾酮合成酶家族蛋白相同的保守結(jié)構(gòu)域;它與同科旋蒴苣苔( Dorcoceras hygrometricum, KZV37788)的同源性高達(dá)92%,兩者在系統(tǒng)進(jìn)化樹上聚為一支。【結(jié)論】酮脂酰-輔酶A合成酶基因與刺齒報(bào)春苣苔葉表面的蠟質(zhì)合成有關(guān),對植物的抗旱及應(yīng)對生物脅迫發(fā)揮重要調(diào)控作用。

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