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幾種鹽生植物與甜生植物NHX1生物信息學(xué)分析

作者:郭曉農(nóng); 魏芳; 柏家林; 馬忠仁; 王鎖民 蘭州大學(xué)草地農(nóng)業(yè)科技學(xué)院; 草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)國家重點(diǎn)實驗室; 蘭州730020; 西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院; 蘭州730030; 西北民族大學(xué); 生物醫(yī)學(xué)研究中心; 蘭州730030

摘要:為了研究鹽生植物與甜土植物Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1 (NHX1)在結(jié)構(gòu)及功能方面的差異,本研究采用生物信息學(xué)方法預(yù)測和分析甜土植物(擬南芥,水稻,小麥)與鹽生植物(角果堿蓬,濱藜,鹽角草)的Na~+/H~+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白1 (NHX1)的基本性質(zhì)、親疏水性、N-糖基化位點(diǎn)、磷酸化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)及其同源性關(guān)系。結(jié)果顯示,鹽生植物與甜土植物NHX1基因基本理化性質(zhì)基本相同,都是穩(wěn)定蛋白,氨基酸組成、親疏水性差異不明顯。但是N-糖基化位點(diǎn)、磷酸化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)、多重序列比對分析存在明顯的差異。上述研究結(jié)果可以為后續(xù)耐鹽堿作物的分子植物育種提供一定的理論基礎(chǔ)。

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分子植物育種

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