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毛果楊I(lǐng)TPK家族基因的鑒定及特性分析

作者:李新林; 金華; 鄒吉祥; 金純伊; 朱桐; 程文瓊; 王鑄; 樊家昊 大連民族大學(xué)環(huán)境與資源學(xué)院; 大連116600

摘要:1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶(ITPK)作為磷脂酰肌醇信號通路的一種重要的調(diào)控酶,在動物、植物、線蟲的生物信號傳導(dǎo)和生長發(fā)育中起到重要作用。為了進(jìn)一步對毛果楊中ITPK家族基因進(jìn)行系統(tǒng)分析,利用毛果楊的基因組數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學(xué)方法,對毛果楊I(lǐng)TPK基因家族的基因結(jié)構(gòu)、染色體位置、蛋白結(jié)構(gòu)域、細(xì)胞定位預(yù)測、系統(tǒng)進(jìn)化、基因表達(dá)進(jìn)行了分析。結(jié)果表明:毛果楊中的ITPK家族基因共有6個成員,分布于毛果楊的6條染色上。進(jìn)化樹分析顯示毛果楊I(lǐng)TPK基因可分為3個亞家族;基于保守域分析顯示,Pt ITPK1~PtITPK5均含有3個保守結(jié)構(gòu)域,Pt ITPK6只含有2個保守結(jié)構(gòu)域;毛果楊I(lǐng)TPK基因在各個器官或組織中均有表達(dá)。研究結(jié)果為進(jìn)一步克隆該家族基因與驗證ITPK家族基因與生物逆境脅迫相關(guān)提供科學(xué)依據(jù)。

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