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腦缺血大鼠模型的轉錄組學研究

作者:王穎慧; 王雅麗; 陳文; 張珂; 王航宇; 王金輝; 田星 石河子大學藥學院; 新疆植物藥資源利用教育部重點實驗室; 石河子832000

摘要:目的研究腦缺血大鼠與正常大鼠在基因表達方面的差異。方法將16只雄性大鼠隨機分為正常組、模型組,采用線栓法制備大鼠左側腦缺血模型,進行RNA-seq測序。結果兩組之間存在530個差異基因,其中包括37個顯著差異基因和98個極顯著差異基因。基因本體(GO)分析發(fā)現(xiàn),生物學過程和分子功能部分相關基因整體呈現(xiàn)上調(diào)趨勢,細胞組分相關的基因既有顯著上調(diào)趨勢也有顯著下調(diào)趨勢;通過基因和基因組京都百科全書數(shù)據(jù)庫(KEGG)通路分析發(fā)現(xiàn),P53信號通路相關基因顯著下調(diào),而固醇激素生物合成通路相關基因則顯著上調(diào)。結論腦缺血的形成可能與細胞凋亡、突觸后密度有很大關系,P53信號通路的下調(diào)、類固醇激素生物合成通路的上調(diào)可能影響腦缺血的形成。

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