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短短芽孢桿菌GZDF3嗜鐵素合成酶基因 Gene5693 的生物信息學(xué)分析及原核表達(dá)

作者:袁林; 賈化可; 盛淼淼; 王兵; 曾麗娜; 劉紅美; 隆耀航 貴州醫(yī)科大學(xué)醫(yī)藥生物技術(shù)研究中心; 貴州貴陽550025; 貴州醫(yī)科大學(xué)生物與醫(yī)學(xué)工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 貴州貴陽550025; 貴州省教育廳免疫細(xì)胞與抗體工程研究中心; 貴州貴陽550025; 貴州醫(yī)科大學(xué)生物與工程學(xué)院; 貴州貴陽550025

摘要:目的:從短短芽孢桿菌GZDF3菌株中克隆嗜鐵素合成酶基因Gene5693,構(gòu)建其原核表達(dá)載體并進(jìn)行重組表達(dá)。方法:利用antiSMASH軟件對GZDF3全基因組序列進(jìn)行次級代謝物預(yù)測分析,然后采用ExPASy在線分析預(yù)測嗜鐵素合成酶基因Gene5693的基本理化性質(zhì)并進(jìn)行重組表達(dá)。結(jié)果:生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,短短芽孢桿菌GZDF3全基因組序列與Petrobactin嗜鐵素基因簇的相似性為83%,Gene5693基因編碼的蛋白與Petrobactin嗜鐵素編碼的蛋白AsbE的相似性為51.06%;Gene5693編碼蛋白氨基酸長度為327個氨基酸,分子量為39.05kDa,等電點(diǎn)(pI)為4.94,為酸性親水性蛋白;Gene5693基因的PCR擴(kuò)增成功獲得預(yù)測的Gene5693基因片段,菌落PCR及重組DNA分子的雙酶切電泳結(jié)果顯示成功構(gòu)建重組質(zhì)粒;SDS-PAGE結(jié)果表明Gene5693編碼的蛋白大小與生物信息學(xué)預(yù)測的結(jié)果一致。結(jié)論:成功克隆了嗜鐵素合成基因Gene5693,并進(jìn)行了重組表達(dá)。

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貴州醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)

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