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人類CD4^+T細(xì)胞中核小體定位與DNA甲基化的分布特征研究

作者:崔穎; 李燕; 王紅巖 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息科學(xué)與技術(shù)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程教研室; 黑龍江哈爾濱150081; 東北師范大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院; 吉林長春130024

摘要:目的研究人類CD4+T細(xì)胞中核小體定位與DNA甲基化位點(diǎn)的分布特征,探討二者的相關(guān)性以及在基因表達(dá)過程中的作用機(jī)制。方法通過生物信息學(xué)匹配算法及分析方法,采用Perl語言和R語言進(jìn)行編程,使用SAM進(jìn)行差異表達(dá)基因篩選,通過David軟件進(jìn)行功能注釋,研究人類CD4+T細(xì)胞中核小體定位和甲基化位點(diǎn)的分布特征以及二者在基因表達(dá)中的作用。結(jié)果研究發(fā)現(xiàn)人類基因組7個(gè)分區(qū)中,核小體的甲基化水平在激活狀態(tài)時(shí)呈下降趨勢(shì),在甲基化核小體定位的甲基化水平發(fā)生了明顯的改變,與核小體定位模式密切相關(guān)。結(jié)論核小體定位和甲基化在基因組定位上具有協(xié)同關(guān)系,在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮著重要作用。

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哈爾濱醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)

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