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水中大腸菌群微滴數(shù)字PCR定量檢測方法的建立

作者:馬薇; 孔義軍; 吳偉健; 劉桂環(huán) 澳門自來水股份有限公司; 澳門999078; 生態(tài)環(huán)境部環(huán)境規(guī)劃院; 北京100012

摘要:以大腸菌群的lacZ基因為靶基因,建立一種快速、穩(wěn)定、靈敏、特異的微滴數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Droplet Digital Polymerase Chain Reaction,ddPCR)定量檢測方法。對ddPCR反應(yīng)體系中試劑濃度、退火溫度等條件優(yōu)化篩選的同時,考察了方法的線性范圍、精密度和定量限。最終確定反應(yīng)體系中的最佳引物和探針濃度分別為0.2和0.5μmol/L,最佳退火溫度為56℃。大腸菌群lacZ基因組DNA濃度范圍為3.95~7.80×10^4拷貝(copies)/20μL ddPCR反應(yīng)液時,方法的線性關(guān)系良好(R^2=0.999)。文章所建立的方法可檢出每微升單個拷貝數(shù)的大腸菌群lacZ基因組DNA,且具有快速測定、靈敏度高、特異性強、重復(fù)性良好等特點,為建立水污染早期應(yīng)急機制提供了重要的參考價值。

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環(huán)境保護科學(xué)

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