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高粱AGO蛋白家族基因鑒定及表達(dá)分析

作者:林俊俊; 郭懷剛; 董潔靜; 楊克軍; 張海燕; 李佐同; 趙長(zhǎng)江; 徐晶宇 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)農(nóng)學(xué)院/黑龍江省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)栽培技術(shù)與作物種質(zhì)改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/黑龍江省秸稈資源化利用工程技術(shù)研究中心/黑龍江省普通高校寒地作物種質(zhì)改良與栽培重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 黑龍江大慶163319

摘要:Argonaute (AGO)蛋白是RNA介導(dǎo)的沉默復(fù)合物RISC的核心成分,在小RNA、Dicer-like酶等的協(xié)同下共同激發(fā)RNA沉默反應(yīng)。為闡明高粱中AGO蛋白的功能,本研究采用生物信息學(xué)的方法首次在高粱全基因組水平鑒定15個(gè)SbAGOs,分別定位于高粱的7條染色體上,根據(jù)氨基酸序列將其劃分為三個(gè)亞家族。亞家族Ⅲ中SbAGO7和SbAGO3都含有3個(gè)外顯子,亞家族Ⅱ中SbAGO4和SbAGO6都具有22個(gè)外顯子,成員最多的亞家族Ⅰ中基因外顯子數(shù)量介于19~24之間。其中,亞家族Ⅰ中SbAGO1-1和SbAGO1-3、SbAGO1-3和SbAGO1-4、SbAGO5-2和SbAGO5-4發(fā)生過(guò)基因復(fù)制事件,可能存在功能冗余現(xiàn)象。NCBI表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn),SbAGO1-1、SbAGO1-2、SbAGO1-3和SbAGO4在高粱不同組織器官和生長(zhǎng)發(fā)育階段均有較高表達(dá),其中SbAGO1-1和SbAGO1-2、SbAGO1-3和SbAGO4表達(dá)時(shí)期和表達(dá)量基本一致,可能在調(diào)控高粱生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮協(xié)同作用。高溫、干旱及高溫與干旱復(fù)合逆境表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),高溫處理引起5個(gè)SbAGOs基因差異表達(dá),干旱處理SbAGOs表達(dá)變化不明顯,復(fù)合逆境引起7個(gè)SbAGOs基因差異表達(dá);2個(gè)處理共同差異表達(dá)基因?yàn)镾bAGO1-3、SbAGO1-1、SbAGO5-2和SbAGO3,表達(dá)量變化趨勢(shì)相近。其中SbAGO1-1、SbAGO1-2、SbAGO1-3和SbAGO5-6下調(diào)表達(dá),SbAGO3、SbAGO5-2、SbAGO1-4和SbAGO10上調(diào)表達(dá)。本研究結(jié)果為揭示SbAGO蛋白功能和發(fā)掘高粱的抗逆育種靶向基因資源提供了一定的理論依據(jù)。

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