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基于GEO數(shù)據(jù)的精神分裂癥差異表達基因分析

作者:劉蜀東; 魏曉云; 李松; 曾真; 秦麗; 胡黎丹 重慶市精神衛(wèi)生中心; 重慶市400030

摘要:目的 比較精神分裂癥患者與正常人尸檢腦組織基因水平上的表達差異,分析差異表達基因調(diào)控的功能通路。方法 GEO數(shù)據(jù)庫下載精神分裂癥患者與正常人的尸檢腦組織轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),通過整合生物信息方法分析顯著差異表達基因,利用GO和KEGG pathway數(shù)據(jù)庫分析基因富集的功能和參與的通路。結(jié)果 鑒定到501個差異表達基因,GO功能顯著富集30個GO條目,主要與神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、神經(jīng)肽信號通路、胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導、突觸調(diào)節(jié)、軸突末端、氯離子跨膜運輸?shù)壬窠?jīng)系統(tǒng)功能相關(guān); KEGG數(shù)據(jù)庫共4個顯著富集通路,涉及有絲分裂素激活蛋白激酶(MAPK)信號通路,3’-5’-環(huán)腺苷酸(c AMP)信號通路,硫中繼系統(tǒng),甘油磷脂代謝通路等。結(jié)論 精神分裂癥差異表達基因影響神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育以及神經(jīng)遞質(zhì)系統(tǒng)形成與信號傳輸。

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精神醫(yī)學

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