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羚牛苦味受體3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息學(xué)分析

作者:周明; 余姣姣; 李彪; 歐陽(yáng)菠; 楊建東 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院; 成都611130

摘要:Tas2R3是苦味受體基因家族中一個(gè)重要的成員,為了進(jìn)一步了解和研究羚牛(Budorcas taxicolor)苦味受體基因的結(jié)構(gòu)和功能,本研究對(duì)羚??辔妒荏w3 (Tas2R3)基因進(jìn)行了克隆和生物信息學(xué)分析(GenBank登錄號(hào):MG650195)。結(jié)果顯示,羚牛Tas2R3基因編碼區(qū)(coding sequence, CDS)序列全長(zhǎng)951 bp,共編碼316個(gè)氨基酸,以亮氨酸含量最高,谷氨酰胺含量最低。其蛋白質(zhì)等電點(diǎn)為9.68,分子量為51.96 kD。高級(jí)結(jié)構(gòu)功能預(yù)測(cè)顯示,二級(jí)結(jié)構(gòu)以α-螺旋為主,蛋白質(zhì)為堿性、穩(wěn)定的親水性蛋白,由4個(gè)胞外區(qū)、7個(gè)跨膜區(qū)和4個(gè)胞內(nèi)區(qū)組成。預(yù)測(cè)到2種類(lèi)型共8個(gè)糖基化功能位點(diǎn)和4種類(lèi)型共15個(gè)磷酸化功能位點(diǎn)。通過(guò)比較Tas2R3基因種間相似性發(fā)現(xiàn),在偶蹄目中具有很高的同源性,羚牛與綿羊(Ovis aries)的相似性最高(0.98),與褐家鼠(Rattus norvegicus)最低(0.52)。用羚牛、綿羊等12個(gè)物種的Tas2R3基因CDS序列構(gòu)建的NJ樹(shù)與ME樹(shù)結(jié)構(gòu)一致,表明Tas2R3基因適合用于構(gòu)建不同物種間的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

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基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)

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