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應(yīng)用生物信息學(xué)鑒定無(wú)功能型垂體瘤驅(qū)動(dòng)基因及特效藥物篩選

作者:彭羿達(dá); 王新慧; 葛琳娜; 姜珊珊; 彭暢; 鐘升; 金日華; 王毛雨 吉林大學(xué)軟件學(xué)院; 長(zhǎng)春130000

摘要:目的通過(guò)無(wú)功能型垂體瘤(NFPA)致病驅(qū)動(dòng)基因的鑒定以及藥物的篩選驗(yàn)證,為生物信息學(xué)在自然科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用提供思路。方法基于基因表達(dá)微陣列芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)基因的分析。采用富集度分析(GO分析)、京都基因與基因組百科全書(KEGG)分析以及蛋白質(zhì)互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)關(guān)系構(gòu)建的方法,探究差異表達(dá)基因富集的生物學(xué)功能,鑒定出NFPA核心驅(qū)動(dòng)基因。同時(shí)采用CCK-8、克隆形成、體外劃痕以及流式測(cè)細(xì)胞凋亡等實(shí)驗(yàn)方法驗(yàn)證藥物藥效。結(jié)果 CALM1、PRDM10和RIPK4是原代人垂體無(wú)功能腺瘤(NFPA)致病驅(qū)動(dòng)基因,STO-609可以作為抗NFPA的潛在治療藥物。此外,NFPA很可能多方面與帕金森病密切相關(guān)。結(jié)論基于計(jì)算機(jī)技術(shù),應(yīng)用生物信息學(xué)方法可進(jìn)行腫瘤驅(qū)動(dòng)基因的篩選,依據(jù)核心基因能夠進(jìn)行治療靶點(diǎn)的設(shè)計(jì)以及藥物藥效的驗(yàn)證。將生物信息學(xué)手段應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域的研究意義重大,且切實(shí)可行。

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