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基于ITS的貴州省30個(gè)樹(shù)種的DNA條形碼研究

作者:成宇; 蔡莎莎; 舒劍鋒; 袁昊; 伍穎; 凃翠; 楊鵬; 趙財(cái) 貴州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 貴州貴陽(yáng)550025

摘要:本文對(duì)貴州省19科26屬30種林木樹(shù)種植物ITS序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增及測(cè)序,用MEGA5.0軟件對(duì)序列進(jìn)行比對(duì)分析序列信息,用最近距離法計(jì)算種內(nèi)及種間遺傳距離,通過(guò)鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果表明,供試樹(shù)種的DNA總長(zhǎng)度為506~684bp,其中平均G+C含量為64%,種內(nèi)平均遺傳距離為0.013,種間平均遺傳距離為0.236;基于ITS序列構(gòu)建的聚類(lèi)樹(shù)顯示,對(duì)30種林木樹(shù)種的鑒定成功率為83%,因此,推薦ITS序列作為林木樹(shù)種DNA條形碼的候選序列。

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山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào)

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