摘要：差異性表達(dá)分析是轉(zhuǎn)錄組研究的核心目標(biāo)之一,對(duì)于揭示基因功能和調(diào)控規(guī)律具有重要意義。但該分析屬于多步迭代且耗時(shí)較長(zhǎng)的計(jì)算密集型過程,軟件之間具有復(fù)雜的數(shù)據(jù)依賴關(guān)系,輸入輸出格式不盡相同。傳統(tǒng)方式下,軟件安裝與使用復(fù)雜、繁瑣的手動(dòng)操作、分析環(huán)境的不易遷移以及無法按需集成都是有待解決的關(guān)鍵問題。針對(duì)上述問題,文中首次將云開源項(xiàng)目Docker容器技術(shù)應(yīng)用于生物信息領(lǐng)域,提出一種高效自動(dòng)化的轉(zhuǎn)錄組差異性表達(dá)分析方法。首先將最佳實(shí)踐流程在Docker容器中內(nèi)置與集成,其次多腳本聯(lián)動(dòng)與Web服務(wù)相結(jié)合,最后形成一個(gè)輕量級(jí)、易遷移、高效自動(dòng)化的轉(zhuǎn)錄組差異性表達(dá)分析“黑匣子”。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與傳統(tǒng)方式相比,該方法的分析時(shí)間縮短約72%,效率提升2倍多,為研究人員提供了更高效的技術(shù)支持。