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基于線(xiàn)粒體COⅡ基因和D-loop區(qū)序列對(duì)江西安南光唇魚(yú)(Acrossocheilus)物種鑒定及系統(tǒng)發(fā)育位置分析

作者:薛艷潔; 潘娜; 李明云 寧波大學(xué)應(yīng)用海洋生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 寧波315211

摘要:以采自江西贛州安南的野生魚(yú)為實(shí)驗(yàn)材料,分別設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增其線(xiàn)粒體DNACOⅡ和D-loop序列并進(jìn)行序列比對(duì)分析,經(jīng)擴(kuò)增得到的COⅡ序列全長(zhǎng)為691bp,D-loop序列的全長(zhǎng)為937~944bp,其中COⅡ序列中A、T、G、C的平均占比分別為31.00%、25.80%、15.30%和27.90%,而D-loop序列的占比則分別為35.60%、32.30%、12.00%和20.00%,兩序列都是A+T含量高于G+C,G的含量在4種堿基中最低。COⅡ序列中僅存在6個(gè)堿基位點(diǎn)的轉(zhuǎn)換,D-loop則有多個(gè)堿基位點(diǎn)存在轉(zhuǎn)換、顛換、缺失或插入,群體內(nèi)遺傳距離分別為0.0075、0.0050。用最大似然法構(gòu)建的COⅡ和D-loop系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示贛州安南光唇魚(yú)與半刺光唇魚(yú)(Acrossocheilus hemispinus)親緣性最近,序列相似性分別為98.70%、98.69%,遺傳距離最近分別為0.0130、0.0260,未達(dá)到種間分化的水平(0.05)。2個(gè)序列分析結(jié)果一致,結(jié)合外部形態(tài)特征觀(guān)察,可以斷定贛州安南光唇魚(yú)與半刺光唇魚(yú)為同一種,研究為江西贛州安南光唇魚(yú)的資源利用提供了資料。

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