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乳腺癌他莫昔芬耐藥相關(guān)基因及通路的篩選

作者:柴慈曼; 楊紹時(shí) 天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院甲狀腺乳腺外科; 天津300211

摘要:目的 利用美國國家生物技術(shù)信息中心基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫中雌激素受體陽性乳腺癌表達(dá)譜芯片進(jìn)行生物信息學(xué)分析, 篩選他莫昔芬耐藥的關(guān)鍵基因和信號(hào)通路. 方法: 利用基因芯片 GSE26459, R 軟件分析得到差異基因, DAVID 進(jìn)行 Gene Ontology 和KEGG 富集分析, STRING繪制蛋白作用網(wǎng)絡(luò).GSEA富集分析得到耐藥相關(guān)通路及基因.結(jié)合蛋白作用網(wǎng)絡(luò)篩選目標(biāo)基因并驗(yàn)證.結(jié)果: 篩選出差異基因1 516 個(gè), 上調(diào)基因 505 個(gè), 下調(diào)基因 624 個(gè).通路富集分析發(fā)現(xiàn)脂肪酸代謝通路、 細(xì)胞粘附、 胰島素抵抗等信號(hào)通路在乳腺癌的他莫昔芬耐藥中起重要作用,并在富集通路中篩選出 ACSL1 等候選目標(biāo)基因并驗(yàn)證.結(jié)論: 利用生物信息學(xué)有效分析他莫昔芬耐藥的基因芯片數(shù)據(jù), 為他莫昔芬耐藥的治療靶點(diǎn)提供重要依據(jù).

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天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)

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