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分枝桿菌Rv2450c T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)及分析

作者:王培東; 何俊才; 周放; 張露; 鄭輝; 劉; 余曉麗 武漢輕工大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院; 湖北武漢430023; 武漢市金銀潭醫(yī)院; 湖北武漢430000

摘要:對(duì)Rv2450c進(jìn)行T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)分析。在NCBI上獲取Rv2450c蛋白質(zhì)序列,運(yùn)用ExPASY(ProtParam)對(duì)Rv2450c蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)分析,Expasyde的Protscale程序?qū)v2450c蛋白進(jìn)行疏水性分析,NetMHC在線基本軟件預(yù)測(cè)并分析Rv2450c的CD4^+T細(xì)胞表位的分布情況;Bimas、NetMHC、和NetCTL軟件預(yù)測(cè)并分析Rv2450c的CD8^+T細(xì)胞表位的分布情況。經(jīng)篩選得出CD4^+T細(xì)胞的優(yōu)勢(shì)表位5個(gè),CD8^+T細(xì)胞優(yōu)勢(shì)表位2個(gè);綜合CD^+T細(xì)胞表位與CD8^+T細(xì)胞表位分析結(jié)果,最終篩選出T細(xì)胞表位預(yù)測(cè)為:SQGIRAWP159—166。預(yù)測(cè)出的T細(xì)胞候選表位可為結(jié)核病疫苗開發(fā)提供參考。

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武漢輕工大學(xué)學(xué)報(bào)

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