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湖羊卵巢不同發(fā)育階段的miRNA鑒定與分析

作者:解領(lǐng)麗; 李嬡; 黃萬龍; 張秀秀; 苗向陽 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所; 動物營養(yǎng)學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 北京100193

摘要:旨在分析不同發(fā)育階段綿羊卵巢組織中miRNA的表達(dá)水平,了解miRNA表達(dá)及其調(diào)控機(jī)理。本研究采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)鑒定1和8月齡湖羊卵巢組織中的miRNA,運(yùn)用生物信息學(xué)方法對差異表達(dá)的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測,并對靶基因進(jìn)行GO和KEGG功能注釋,篩選參與卵巢發(fā)育的miRNAs。結(jié)果顯示,6個樣品中檢測到的已知miRNA個數(shù)分別為2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088,新miRNA的個數(shù)分別為613、567、668、640、662、450。篩選到701個差異表達(dá)novel miRNAs,38個差異表達(dá)已知miRNAs。對差異表達(dá)miRNAs的靶基因進(jìn)行GO和KEGG分析,發(fā)現(xiàn)主要富集在血管內(nèi)皮生長因子通路和卵巢類固醇生成等過程。對3個差異miRNAs進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證,與測序結(jié)果一致。oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生長等與卵巢發(fā)育相關(guān)的生物過程。oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因調(diào)控顆粒細(xì)胞增殖和類固醇生成,可能參與調(diào)控綿羊卵巢發(fā)育。

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畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào)

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