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單核細(xì)胞增生李斯特菌新型轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子Lmo2672分子特征及其系統(tǒng)進(jìn)化分析

作者:李杰; 孟慶玲; 喬軍; 張星星; 王曉婷; 李妍; 張國武; 蔡擴(kuò)軍; 才學(xué)鵬 石河子大學(xué)動物科技學(xué)院; 石河子832003; 新疆農(nóng)墾科學(xué)院綿羊遺傳改良與健康養(yǎng)殖省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 石河子832000; 烏魯木齊市動物疾病控制與診斷中心; 烏魯木齊830063; 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所; 蘭州730046

摘要:利用PCR方法擴(kuò)增單核細(xì)胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)野毒株SB5新型轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子lmo2672基因,進(jìn)行克隆、測序,對其編碼蛋白的二三級結(jié)構(gòu)、理化特性、蛋白結(jié)構(gòu)域等分子特征進(jìn)行預(yù)測分析,并進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果顯示:LM-SB5lmo2672基因全長807bp,共編碼268aa;二級結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn),該蛋白含有1個(gè)DNA結(jié)合域(185~259aa),2個(gè)由螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(helix-turn-helix)構(gòu)成的HTH-18結(jié)構(gòu)域(184~198aa,226~249aa),位于整個(gè)蛋白的C端,無信號肽序列及跨膜結(jié)構(gòu);序列比較發(fā)現(xiàn),Lmo2672屬于AraC家族轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白,其核苷酸序列與NTSN株(4b型)同源性為99.63%;與國際標(biāo)準(zhǔn)株EGD-e株(1/2a型)的同源性為97.77%;系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,LM-SB5lmo2672核苷酸序列與譜系Ⅱ型NTSN等菌株親緣關(guān)系較近,而與譜系Ⅰ型菌株標(biāo)準(zhǔn)株EGD-e等親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。該研究結(jié)果為下一步探討lmo2672基因在LM毒力和環(huán)境應(yīng)激中的調(diào)控作用奠定了理論基礎(chǔ)。

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