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一個罕見HLA—C等位基因間重組家系的遺傳背景研究

作者:鄒紅巖; 羊婷婷; 李楨 深圳市組織配型與免疫遺傳醫(yī)學(xué)重點實驗室深圳市血液中心; 518035

摘要:目的 研究HLA-C等位基因座位上的交換重組,探討HLA新等位基因產(chǎn)生的分子遺傳背景.方法 采集擬進(jìn)行造血干細(xì)胞移植的1例慢性粒細(xì)胞白血病患者、患者父母以及2名哥哥的靜脈血,采用AlleleSEQR HLA 測序分型試劑進(jìn)行HLA-A、C、B、DRB1和DQB1共5個位點的高分辨基因分型;再采用Protrans S4 HLA單倍體測序技術(shù)分離2個HLA-C等位基因,以確定序列異常的1個C等位基因;進(jìn)一步采用分子克隆和測序方法進(jìn)行患者及父母HLA-C等位基因的全長單倍體序列分析.按遺傳規(guī)律分析該家系的HLA 5個位點的連鎖單倍型,同時將HLA-C等位基因全長序列經(jīng)IMGT/HLA Database中的"BLAST"程序進(jìn)行序列的對比,以確定C等位基因重組發(fā)生的精確位置.結(jié)果 經(jīng)HLA測序及遺傳家系分析,該家系中父親的2條HLA連鎖單倍型分別為a:A*0207-C*010201-B*550201-DRB1*090102-DQB1*030302與b:A*240201-C*120202-B*5201-DRB1*1502-DQB1*0601;母親的分別為:c:A*300101-C*060201-B*130201-DRB1*0405-DQB1*0401與d:A*110101-C*070201-B*4001-DRB1*080302-DQB1*0601.患者的2名哥哥均分別正常遺傳了父母的2條單倍體a、d及b、c.患者的2條單倍體分別為母源單倍體c及父源重組單倍體a/b,其中A*240201來自父親的1條染色單體b,而B*550201-DRB1*090102-DQB1*030302則來自父親的另1條染色單體a.對比患者攜帶的C未知新等位基因與父親的1對C*010201 、C*120202等位基因的全長單倍體序列,推斷父親的2條染色單體在減數(shù)分裂時,由于HLA-C等位基因的第273位至330位堿基區(qū)域之間發(fā)生了交換,重組后形成新的C等位基因及單倍型并遺傳給了患者.該C新等位基因的全長序列已遞交GenBank,并被世界衛(wèi)生組織HLA因子命名委員會正式命名為C*0121.結(jié)論 本研究發(fā)現(xiàn)了1個罕見的中國漢族人群HLA-C基因座位上的基因重組家系,闡明了HLA-C*0121新等位基因及單倍型的產(chǎn)生來源,為更深入研?

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