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甜菜STPK家族鑒定及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

作者:端木慧子; 牛志新; 李海英 黑龍江大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物技術(shù)教育部工程研究中心; 哈爾濱150500; 黑龍江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/黑龍江省普通高校分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 哈爾濱150080

摘要:絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(STPK)參與調(diào)節(jié)植物體內(nèi)的多種信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、脅迫應(yīng)答過程,但在甜菜中STPK的研究相對較少。為了揭示甜菜中STPK家族的特征從而預(yù)測其功能,本研究采用生物信息學(xué)方法,從全基因組水平對甜菜STPK家族進(jìn)行了鑒定與分析,并構(gòu)建了STPK蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果表明,甜菜基因組中鑒定到148個(gè)STPK,分為9個(gè)亞類;且這些STPK均含有11個(gè)蛋白激酶的保守結(jié)構(gòu)域;甜菜STPK互作網(wǎng)絡(luò)包括8個(gè)子網(wǎng);這些蛋白質(zhì)與發(fā)育和刺激應(yīng)答相關(guān)。本研究結(jié)果可為甜菜遺傳育種提供理論支持與基因資源。

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