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基于多尺度熵的DNA序列相似性分析

作者:張靜; 周小安; 趙宇 深圳大學(xué)信息工程學(xué)院; 廣東深圳518000

摘要:DNA序列的相似性分析已成為當(dāng)前生物信息學(xué)科中的研究熱點,對分析算法的需求也逐步增加,基于樣本熵的DNA序列相似性分析方法存在一定的效率問題。本文提出了一種基于多尺度熵的分析方法,以7種病毒DNA序列作為實驗研究的對象,采用整數(shù)法將其分別表示為時間序列,而后通過對比多個時間尺度下序列之間樣本熵互值大小來顯示序列之間的相關(guān)性,并與原有的樣本熵算法的分析結(jié)果進(jìn)行比較。實驗表明,本文提出多尺度熵分析方法是切實可行的。

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