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新疆、甘肅黍稷資源的遺傳多樣性與群體遺傳結(jié)構(gòu)研究

作者:薛延桃; 陸平; 史夢(mèng)莎; 孫昊月; 劉敏軒; 王瑞云 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所; 北京100081; 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 山西太谷030801; 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)作物品種資源研究所/農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/雜糧種質(zhì)資源發(fā)掘與遺傳改良山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 山西太原030031

摘要:新疆、甘肅是我國(guó)古代絲綢之路的必經(jīng)之地,同時(shí)也是黍稷的主要種植區(qū)。研究該地區(qū)黍稷種質(zhì)資源的遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu),對(duì)于開展黍稷起源進(jìn)化研究,明確黍稷傳播路徑具有重要的意義。本研究利用103對(duì)SSR標(biāo)記對(duì)來(lái)自新疆、甘肅的216份黍稷資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析,共檢測(cè)到299個(gè)等位基因,平均每個(gè)位點(diǎn)產(chǎn)生2.9個(gè)等位基因,平均Shannon’s指數(shù)為0.7360,平均觀測(cè)雜合度為0.6298,平均期望雜合度為0.5497,多態(tài)性信息含量指數(shù)為0.0688~0.7786,均值0.4714,具有中度多態(tài)性。216份黍稷資源的近交系數(shù)為0.5870,遺傳分化系數(shù)為0.0383,遺傳分化程度很小。甘肅資源的等位基因數(shù)、Shannon-Weaver多樣性指數(shù)、Nei’s期望雜合度和PIC值分別為2.8252、0.7347、0.4501和0.4674,其遺傳參數(shù)值均大于新疆資源,表明甘肅種質(zhì)資源的遺傳多樣性較新疆更豐富?;谶z傳距離的聚類分析將216份黍稷資源分為5個(gè)類群,類群Ⅰ~Ⅳ共包含7份黍稷資源,與別的資源遺傳關(guān)系較遠(yuǎn);96%的資源集中于類群Ⅴ,在遺傳距離為0.38處,類群Ⅴ又分為4個(gè)亞群,亞群A和亞群D主要包含甘肅資源,亞群B和亞群C主要包含新疆資源,表明新疆與甘肅資源有明顯分離和相互滲透現(xiàn)象。聚類分析與群體遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果相似,均與生態(tài)地理分布相關(guān)。

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