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玉米SAUR基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析

作者:郭棟; 杜媚; 周寶元; 劉穎慧; 趙明 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所; 北京100081; 河北北方學(xué)院; 張家口075000

摘要:為研究玉米早期應(yīng)答生長素基因SAUR(Small auxin-up RNA)家族,本研究采用全基因組信息鑒定出91個玉米SAUR基因,命名為ZmSAUR。SAUR家族成員基因結(jié)構(gòu)、氨基酸特點、染色體定位及基因進化分析表明,SAUR基因家族在染色體上呈現(xiàn)不均勻分布,其中2號染色體上數(shù)量最多為22個,基因的擴增模式為分散復(fù)制與片段復(fù)制。SAUR基因家族具有相對保守的結(jié)構(gòu),即包含1個保守的Rna DNA結(jié)構(gòu),SAUR蛋白的3D結(jié)構(gòu)含有3個α螺旋和3個β折疊。根據(jù)多物種SAUR蛋白進化樹分析將其分為9個分支,并分析發(fā)現(xiàn)玉米與物種相近的谷子聚在一起。這些信息為玉米SAUR基因家族功能分析奠定了一定的工作基礎(chǔ)。

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植物遺傳資源學(xué)報

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