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利用微衛(wèi)星標記分析山西糜子的遺傳多樣性

作者:王舒婷; 何杰麗; 石甜甜; 陳凌; 王海崗; 王瑞云; 喬治軍 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院; 太谷030801; 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)文理學(xué)院; 太谷030801; 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)作物品種資源研究所/農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室/雜糧種質(zhì)資源發(fā)掘與遺傳改良山西省重點實驗室; 太原030031

摘要:山西是中國糜子主產(chǎn)區(qū)之一,有豐富的地方品種和農(nóng)家種種質(zhì)資源。利用微衛(wèi)星標記分析糜子資源的遺傳多樣性,明確其遺傳背景,便于加強糜子各品種之間的基因交流以及優(yōu)異種質(zhì)的篩選和利用,同時對種質(zhì)資源的親緣關(guān)系分析提供科學(xué)依據(jù)。利用27對SSR引物分析57份山西糜子的遺傳差異,采用PowerMarker 3.25計算每對引物的多態(tài)性信息含量,采用PopGen1.32計算每對引物和兩個生態(tài)區(qū)的觀測等位基因等遺傳參數(shù)。用MEGA5.0構(gòu)建Neighbour-Joining聚類圖,利用Structure 2.3.4鑒定遺傳類群,采用Ntsys2.11進行主成分分析。結(jié)果顯示27對SSR引物共檢測出71個等位變異,平均每個位點擴增出2.6296個等位基因,各引物對的有效等位變異占觀測等位變異的76.94%。各引物對的基因多樣性指數(shù)為0.4140~1.0446,平均為0.7686;PIC為0.0601~0.7158,平均為0.5667。兩生態(tài)區(qū)的觀測雜合度等遺傳參數(shù)相差不大?;贜-J遺傳距離將57份材料分為3個類群,類群Ⅰ屬于黃土高原春夏糜子區(qū),類群Ⅱ、類群Ⅲ均屬均于北方春糜子區(qū)和黃土高原春夏糜子區(qū)。遺傳結(jié)構(gòu)分析將57份糜子材料分為3個類群,綠色類群的基因多樣性指數(shù)和PIC比藍色、紅色類群高。兩種聚類結(jié)果基本一致,分布方式均與地理位置相關(guān)。主成分分析結(jié)果將晉北部材料與晉中、晉南部材料相區(qū)別,說明兩生態(tài)區(qū)糜子的遺傳背景因地理氣候因素有明顯差異,與遺傳結(jié)構(gòu)群體分析結(jié)果一致。研究表明,山西省糜子資源的遺傳多樣性豐富。

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植物遺傳資源學(xué)報

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